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Registro completo
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Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
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Fecha : |
17/05/2022 |
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Actualizado : |
02/12/2022 |
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Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
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Autor : |
PASSOS, J. R. S.; GUERREIRO, D. D.; OTÁVIO, K. S.; SANTOS-NETO, P. C. DOS; SOUZA-NEVES, M.; CUADRO, F.; NUÑEZ-OLIVERA, R.; CRISPO, M.; BEZERRA, M. J. B.; SILVA, R. F.; LIMA, L. F.; FIGUEIREDO, J. R.; BUSTAMANTE-FILHO, I. C.; MENCHACA, A.; MOURA, A. A. |
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Afiliación : |
JOSÉ RENATO S. PASSOS, Laboratório de Fisiologia e Ciências Ômicas, Departamento de Zootecnia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, Brazil; DENISE D. GUERREIRO, Laboratório de Fisiologia e Ciências Ômicas, Departamento de Zootecnia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, Brazil; KAMILA S. OTÁVIO, Laboratório de Fisiologia e Ciências Ômicas, Departamento de Zootecnia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, Brazil; P. C. DOS SANTOS-NETO, Instituto de Reproducción Animal Uruguay, Fundación IRAUy, Montevideo, Uruguay; MARCELA SOUZA-NEVES, Instituto de Reproducción Animal Uruguay, Fundación IRAUy, Montevideo, Uruguay; FEDERICO CUADRO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; Instituto de Reproducción Animal Uruguay, Fundación IRAUy, Montevideo, Uruguay; RICHARD NUÑEZ-OLIVERA, Instituto de Reproducción Animal Uruguay, Fundación IRAUy, Montevideo, Uruguay; MARTINA CRISPO, Unidad de Biotecnología en Animales de Laboratorio, Institut Pasteur de Montevideo, Montevideo, Uruguay; MARIA JÚLIA B. BEZERRA, Laboratório de Fisiologia e Ciências Ômicas, Departamento de Zootecnia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, Brazil; RENATO F. SILVA, Laboratório de Manipulação de Oócitos e Folículos Ovarianos Pré-antrais - LAMOFOPA - Faculdade de Veterinária, Universidade Estadual do Ceará, Fortaleza, Brazil; LARITZA F. LIMA, Laboratório de Manipulação de Oócitos e Folículos Ovarianos Pré-antrais - LAMOFOPA - Faculdade de Veterinária, Universidade Estadual do Ceará, Fortaleza, Brazil; JOSÉ RICARDO FIGUEIREDO, Laboratório de Manipulação de Oócitos e Folículos Ovarianos Pré-antrais - LAMOFOPA - Faculdade de Veterinária, Universidade Estadual do Ceará, Fortaleza, Brazil; IVAN C. BUSTAMANTE-FILHO, aboratório de Biotecnologia da Reprodução Animal, Programa de Pós-graduação em Biotecnologia, Universidade do Vale do Taquari, Lajeado, Brazil; JOSE ALEJO MENCHACA BARBEITO, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; Instituto de Reproducción Animal Uruguay, Fundación IRAUy, Montevideo, Uruguay; ARLINDO A. MOURA, Laboratório de Fisiologia e Ciências Ômicas, Departamento de Zootecnia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, Brazil. |
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Título : |
Global proteomic analysis of preimplantational ovine embryos produced in vitro. |
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Fecha de publicación : |
2022 |
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Fuente / Imprenta : |
Reproduction in Domestic Animals, 2022, Volume 57, Issue 7; pages 784-797. doi: https://doi.org/10.1111/rda.14122 |
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ISSN : |
0936-6768 |
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DOI : |
10.1111/rda.14122 |
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Idioma : |
Inglés |
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Notas : |
Article history: Received 15 February 2022; Accepted 1 April 2022. -- Funding text - The experiments presently described were conducted at the facilities of the (Fundacion IRAUy, Montevideo, Uruguay) and at the (UBAL) of the , Uruguay. Specially, the authors thank Dr. Rosario Durán and Dr. Alejandro Leyva for kindly assisting us in the proteomic experiment. Finnacial support was provided by Fundacion IRAUy; PRONEX 02/2015 (Programa de Apoio a Núcleos de Excelência Pronex/Funcap/CNPq); the Brazilian Research Council?CNPq (grants # 313160/2017‐1 and 438773/2018‐7); Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES), Brazil. Instituto de Reproducción Animal Uruguay Unidad de Biotecnología en Animales de Laboratorio Institut Pasteur de Montevideo. -- Corresponding author: A. Moura, A.; Laboratório de Fisiologia e Ciências Ômicas, Departamento de Zootecnia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, Brazil; email:arlindo.moura@gmail.com -- Menchaca, A.; Instituto de Reproducción Animal Uruguay, Fundación IRAUy, Montevideo, Uruguay; mail:menchaca.alejo@gmail.com |
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Contenido : |
ABSTRACT. -The present study was conducted to characterize the major proteome of preimplantation (D6) ovine embryos produced in vitro. COCs were aspirated from antral follicles (2–6 mm), matured and fertilized in vitro and cultured until day six. Proteins were ex- tracted separately from three pools of 45 embryos and separately run in SDS-PAGE. Proteins from each pool were individually subjected to in-gel digestion followed by LC-MS/MS. Three ‘raw files’ and protein lists were produced by Pattern Lab software, but only proteins present in all three lists were used for the bioinformatics analyses. There were 2,262 proteins identified in the 6-day-old ovine
embryos, including al- bumin, zona pellucida glycoprotein 2, 3 and 4, peptidyl arginine deiminase 6, actin cytoplasmic 1, gamma-actin 1, pyruvate kinase, heat shock protein 90 and protein disulfide isomerase, among others. Major biological processes linked to the sheep embryo proteome were translation, protein transport and protein stabilization, and molecular functions, defined as ATP binding, oxygen carrier activity and oxygen bind- ing. There were 42 enriched functional clusters
according to the 2,147 genes (UniProt database). Ten selected clusters with potential association with embryo development included translation, structural constituent of ribosomes, ribosomes, nucleosomes, structural constituent of the cytoskeleton, microtubule-based process, translation initiation factor activity, regulation of translational initiation, cell body and nucleotide biosynthetic process. The most representative KEEG pathways were ribosome, oxida- tive phosphorylation, glutathione metabolism, gap junction, mineral absorption, DNA replication and cGMP-PKG signalling pathway. Analyses of functional clusters clearly showed differences associated
with the proteome of preimplantation (D6) sheep em- bryos generated after in vitro fertilization in comparison with in vivo counterparts (Sanchez et al., 2021; https://doi.org/10.1111/rda.13897), confirming that the quality of in vitro derived blastocysts are unlike those produced in vivo. The present study portrays the first comprehensive overview of the proteome of preimplantational ovine embryos grown in vitro.
© 2022 Wiley-VCH GmbH. MenosABSTRACT. -The present study was conducted to characterize the major proteome of preimplantation (D6) ovine embryos produced in vitro. COCs were aspirated from antral follicles (2–6 mm), matured and fertilized in vitro and cultured until day six. Proteins were ex- tracted separately from three pools of 45 embryos and separately run in SDS-PAGE. Proteins from each pool were individually subjected to in-gel digestion followed by LC-MS/MS. Three ‘raw files’ and protein lists were produced by Pattern Lab software, but only proteins present in all three lists were used for the bioinformatics analyses. There were 2,262 proteins identified in the 6-day-old ovine
embryos, including al- bumin, zona pellucida glycoprotein 2, 3 and 4, peptidyl arginine deiminase 6, actin cytoplasmic 1, gamma-actin 1, pyruvate kinase, heat shock protein 90 and protein disulfide isomerase, among others. Major biological processes linked to the sheep embryo proteome were translation, protein transport and protein stabilization, and molecular functions, defined as ATP binding, oxygen carrier activity and oxygen bind- ing. There were 42 enriched functional clusters
according to the 2,147 genes (UniProt database). Ten selected clusters with potential association with embryo development included translation, structural constituent of ribosomes, ribosomes, nucleosomes, structural constituent of the cytoskeleton, microtubule-based process, translation initiation factor activity, regulation of translational i... Presentar Todo |
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Palabras claves : |
Embryo development; In vitro fertilization; Mass spectrometry; Oocyte; Ovine; PLATAFORMA SALUD ANIMAL; Proteins. |
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Asunto categoría : |
L10 Genética y mejoramiento animal |
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Marc : |
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500 $aArticle history: Received 15 February 2022; Accepted 1 April 2022. -- Funding text - The experiments presently described were conducted at the facilities of the (Fundacion IRAUy, Montevideo, Uruguay) and at the (UBAL) of the , Uruguay. Specially, the authors thank Dr. Rosario Durán and Dr. Alejandro Leyva for kindly assisting us in the proteomic experiment. Finnacial support was provided by Fundacion IRAUy; PRONEX 02/2015 (Programa de Apoio a Núcleos de Excelência Pronex/Funcap/CNPq); the Brazilian Research Council?CNPq (grants # 313160/2017‐1 and 438773/2018‐7); Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES), Brazil. Instituto de Reproducción Animal Uruguay Unidad de Biotecnología en Animales de Laboratorio Institut Pasteur de Montevideo. -- Corresponding author: A. Moura, A.; Laboratório de Fisiologia e Ciências Ômicas, Departamento de Zootecnia, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, Brazil; email:arlindo.moura@gmail.com -- Menchaca, A.; Instituto de Reproducción Animal Uruguay, Fundación IRAUy, Montevideo, Uruguay; mail:menchaca.alejo@gmail.com
520 $aABSTRACT. -The present study was conducted to characterize the major proteome of preimplantation (D6) ovine embryos produced in vitro. COCs were aspirated from antral follicles (2–6 mm), matured and fertilized in vitro and cultured until day six. Proteins were ex- tracted separately from three pools of 45 embryos and separately run in SDS-PAGE. Proteins from each pool were individually subjected to in-gel digestion followed by LC-MS/MS. Three ‘raw files’ and protein lists were produced by Pattern Lab software, but only proteins present in all three lists were used for the bioinformatics analyses. There were 2,262 proteins identified in the 6-day-old ovine embryos, including al- bumin, zona pellucida glycoprotein 2, 3 and 4, peptidyl arginine deiminase 6, actin cytoplasmic 1, gamma-actin 1, pyruvate kinase, heat shock protein 90 and protein disulfide isomerase, among others. Major biological processes linked to the sheep embryo proteome were translation, protein transport and protein stabilization, and molecular functions, defined as ATP binding, oxygen carrier activity and oxygen bind- ing. There were 42 enriched functional clusters according to the 2,147 genes (UniProt database). Ten selected clusters with potential association with embryo development included translation, structural constituent of ribosomes, ribosomes, nucleosomes, structural constituent of the cytoskeleton, microtubule-based process, translation initiation factor activity, regulation of translational initiation, cell body and nucleotide biosynthetic process. The most representative KEEG pathways were ribosome, oxida- tive phosphorylation, glutathione metabolism, gap junction, mineral absorption, DNA replication and cGMP-PKG signalling pathway. Analyses of functional clusters clearly showed differences associated with the proteome of preimplantation (D6) sheep em- bryos generated after in vitro fertilization in comparison with in vivo counterparts (Sanchez et al., 2021; https://doi.org/10.1111/rda.13897), confirming that the quality of in vitro derived blastocysts are unlike those produced in vivo. The present study portrays the first comprehensive overview of the proteome of preimplantational ovine embryos grown in vitro. © 2022 Wiley-VCH GmbH.
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| 1. |  | DE MATTOS, D.; DE LOS CAMPOS, G.; CORREA, D.; DE BARBIERI, I.; MONTOSSI, F.; SAN JULIÁN, R.; FRUGONI, J.C.; GRATTAROLA, M.; PÉREZ JONES, J. Análisis genético del núcleo fundacional merino fino: carneros padres y generación 2000. ln: INIA Tacuarembó. Proyecto Merino Fino del Uruguay: segunda distribución de carneros generados en el núcleo fundacional de merino fino de la Unidad Experimental Glencoe, INIA Tacuarembó, 1999 - 2001. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2001. p. 20-30 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 273)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 2. | | MONTOSSI, F.; DE MATTOS, D.; MEDEROS, A.; DE BARBIERI, I.; GRATTAROLA, M.; PÉREZ JONES, J. Avances del Proyecto Merino Fino del Uruguay, obtenidos en el núcleo fundacional de la Unidad Experimental Glencoe de INIA Tacuarembó El País Agropecuario, 2001, v. 6, no. 73, p. 25-28.| Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 4. | | MONTOSSI, F.; DE BARBIERI, I.; CIAPPESONI, G.; SOARES DE LIMA, J.M.; GRATTAROLA, M.; PÉREZ JONES, J.; DONAGARAY, F.; FROS, A. Desde el campo experimental al desarrollo del agronegocio lanero proyecto merino fino del Uruguay Revista INIA Uruguay, 2010, no. 21 p. 10-15 (Revista INIA; 21)| Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
| Biblioteca(s): INIA La Estanzuela; INIA Las Brujas; INIA Tacuarembó. |
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| 5. | | GRATTAROLA, M.; PÉREZ JONES, J. Día del merino 2004. ln: INIA Tacuarembó. Sociedad Criadores Merino Australiano del Uruguay. SUL. Proyecto Merino Fino del Uruguay: cuarta distribución de carneros generados en el Núcleo Fundacional de Merino Fino de la la Unidad Experimental Glencoe, 1999 - 2003. Glencoe, Paysandú, 10 de diciembre, 2003. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2003. p. 72-74 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 343)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 6. | | DE BARBIERI, I.; PREVE, F.; MONTOSSI, F.; ABELLA, I.; GRATTAROLA, M.; RISSO, D.; MARTINEZ, H.; FRUGONI, J.; BENTANCURT, M.; LEVRATTO, J.; GARIN, M. Diez años de investigación y desarrollo en producción y calidad de lanas finas y superfinas para los sistemas laneros de la región de basalto:II. Sección 1. Efecto del manejo y sistema de alimentación estratégica sobre la producción y calidad de lana sobre campo natural. In: BERRETTA, E.; MONTOSSI, F.; BRITO, G. (Ed.). Alternativas tecnológicas para los sistemas ganaderos del basalto. Montevideo, UY: INIA, 2014. p. 334-336. (Serie Técnica; 217)| Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
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| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó; INIA Treinta y Tres. |
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| 8. | | MONTOSSI, F.; DE BARBIERI, I.; CIAPPESONI, G.; DE MATTOS, D.; MEDEROS, A.; LUZARDO, S.; SOARES DE LIMA, J.M.; DE LOS CAMPOS, G.; NOLLA, M.; SAN JULIAN, R.; GRATTAROLA, M.; PÉREZ JONES, J.; DONAGARAY, F.; FROS, A. El Proyecto Merino Fino riende cuentas: los productos logrados en los primeros ocho años (1998-2006). El País Agropecuario, 2007, v. 13, no. 151, p. 30-33| Tipo: Artículos en Revistas Agropecuarias |
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| 9. | | DE BARBIERI, I.; MONTOSSI, F.; NOLLA, M.; LUZARDO, S.; GRATTAROLA, M.; PÉREZ JONES, J.; FROS, A.; MEDEROS, A.; DONAGARAY, F. Encuesta de opinión sobre los avances logrados en el Proyecto Merino Fino - Fase I (período 1998 - 2004). ln: INIA Tacuarembó. Unidad Experimental Glencoe. Proyecto Merino Fino del Uruguay: sexta distribución de carneros generados en el núcleo fundacional de merino fino de la Unidad Experimental Glencoe, INIA Tacuarembó, 1999 - 2005. 16 diciembre, Glencoe, Paysandú, 2005. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2005. p. 39-48 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 439)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 10. | | CIAPPESONI, G.; GIMENO, D.; RAVAGNOLO, O.; DE BARBIERI, I.; MONTOSSI, F.; GRATTAROLA, M.; MEDEROS, A. Evaluación genética del núcleo fundacional: caracterización de los animales que se entregan. ln: INIA Tacuarembó. Unidad Experimental Glencoe. Proyecto Merino Fino del Uruguay: sexta distribución de carneros generados en el núcleo fundacional de merino fino de la Unidad Experimental Glencoe, INIA Tacuarembó, 1999 - 2005. 16 diciembre, Glencoe, Paysandú, 2005. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2005. p. 49-74 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 439)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 11. | | DE MATTOS, D.; DE LOS CAMPOS, G.; CORREA, D.; DE BARBIERI, I.; MONTOSSI, F.; SAN JULIÁN, R.; FRUGONI, J.C.; GRATTAROLA, M.; PÉREZ JONES, J.; FROS, A. Evaluación genética del núcleo fundacional merino fino: análisis combinado generaciones 1999 - 2000 - 2001. ln: INIA TACUAREMBÓ. SOCIEDAD CRIADORES MERINO AUSTRALIANO DEL URUGUAY. Proyecto Merino Fino del Uruguay: tercera distribución de carneros generados en el núcleo fundacional de merino fino de la Unidad Experimental Glencoe, INIA Tacuarembó, 1999 - 2002. Paysandú, 12 diciembre 2002. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2002. p. 25-35 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 305)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 13. | | CIAPPESONI, G.; GIMENO, D.; DE BARBIERI, I.; MONTOSSI, F.; GRATTAROLA, M.; MEDEROS, A. Evaluación genética poblacional: caracterización de los animales del Núcleo que se entregan. ln: INIA Tacuarembó. Estación Experimental Glencoe. Proyecto Merino Fino del Uruguay: octava distribución de carneros generados en el núcleo fundacional de Merino fino de la Unidad Experimental Glencoe, 1999-2007, Paysandú, 13 de diciembre, 2006. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2007. p. 8-33 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 523)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 14. | | CIAPPESONI, G.; GIMENO, D.; DE BARBIERI, I.; MONTOSSI, F.; GRATTAROLA, M.; MEDEROS, A. Evaluación genética poblacional: Caracterización de los animales del Núcleo que se entregan (475). In: INIA Tacuarembó. Unidad Experimental Glencoe. Avances obtenidos en el Proyecto Merino Fino del Uruguay: núcleo fundacional Unidad Experimental Glencoe, 1999-2006. Paysandú, 19 diciembre, 2006. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2006. p. 54-78 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 475)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 15. | | CIAPPESONI, G.; GIMENO, D.; RAVAGNOLO, O.; DE BARBIERI, I.; AGUILAR, I.; MONTOSSI, F.; GRATTAROLA, M. Evaluación genética preliminar del Núcleo Fundacional Merino Fino: análisis combinado población Merino fino - generación 2003. ln: INIA Tacuarembó. Sociedad Criadores Merino Australiano del Uruguay. SUL. Proyecto Merino Fino del Uruguay: quinta distribución de carneros generados en el núcleo fundacional de merino fino de la Unidad Experimental Glencoe, INIA Tacuarembó, 1999 - 2004. Glencoe, Paysandú, 10 diciembre, 2004. Tacuarembó (Uruguay): INIA, 2004. p. 69-83 (INIA Serie Actividades de Difusión ; 392)| Biblioteca(s): INIA Tacuarembó. |
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| 16. | | ABELLA, I.; JAURENA, M.; RAMOS, Z.; PREVE, F.; GRATTAROLA, M.; DE BARBIERI, I. Experiencias en la producción de lanas finas en sistemas comerciales del Basalto. In: DE BARBIERI, I.; RAMOS, Z.; MONTOSSI, F. (Ed.). Lana superfina: un camino conjunto de la investigación, la transferencia y la producción. Montevideo (Uruguay): INIA, 2018. p. 11-30 (INIA Serie Técnica; 242)| Tipo: Capítulo en Libro Técnico-Científico |
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